В связи с увеличением количества ветеранов локальных военных конфликтов и лиц, приравненных к ним по льготам, в 1995 году Республиканский госпиталь инвалидов войны переименован в Республиканский госпиталь для ветеранов войн.
Первым главным врачом был назначен Юрий Викторович Воронцов, врач клинической лабораторной диагностики, участник боевых действий. С сентября 1990 года главным врачом назначен Александр Аркадьевич Быстрых, заслуженный работник здравоохранения Удмуртской Республики. С февраля 2012 года Госпиталь возглавлял Сергей Иванович Тоцкий. С августа 2015 года по настоящее время главным врачом Госпиталя является Андрей Александрович Демин, врач-уролог, имеет высшую квалификационную категорию по специальности «организация здравоохранения и общественное здоровье», член некоммерческой организации «Союз госпиталей ветеранов войн России», член Общественного совета по реализации Федерального партийного проекта «Старшее поколение» (партия «Единая Россия»), член общественной организации «Медицинская палата Удмуртской Республики по защите прав и интересов медицинских работников», в 2017 году решением Комитета по делам воинов-интернационалистов при Совете Глав Правительств государств-участников СНГ награжден почетным знаком «25 лет образования Комитета по делам воинов-интернационалистов».
Первым главным врачом был назначен Юрий Викторович Воронцов, врач клинической лабораторной диагностики, участник боевых действий. С сентября 1990 года главным врачом назначен Александр Аркадьевич Быстрых, заслуженный работник здравоохранения Удмуртской Республики. С февраля 2012 года Госпиталь возглавлял Сергей Иванович Тоцкий. С августа 2015 года по настоящее время главным врачом Госпиталя является Андрей Александрович Демин, врач-уролог, имеет высшую квалификационную категорию по специальности «организация здравоохранения и общественное здоровье», член некоммерческой организации «Союз госпиталей ветеранов войн России», член Общественного совета по реализации Федерального партийного проекта «Старшее поколение» (партия «Единая Россия»), член общественной организации «Медицинская палата Удмуртской Республики по защите прав и интересов медицинских работников», в 2017 году решением Комитета по делам воинов-интернационалистов при Совете Глав Правительств государств-участников СНГ награжден почетным знаком «25 лет образования Комитета по делам воинов-интернационалистов».
Госпиталь имеет высокие Правительственные и общественные оценки деятельности учреждения.
На V Всероссийском съезде геронтологов и гериатров с международным участием, проходившем в апреле 2018 года в г. Москва, по результатам подведения итогов работы госпиталей России за 2017 год, по решению организации «Союз госпиталей ветеранов войн России», БУЗ УР «РГВВ МЗ УР» был награжден Дипломом Союза госпиталей и почетным призом, как победитель в номинации «Экономическая эффективность управления».
18 марта 2019 года состоялась торжественная церемония вручения Госпиталю сертификата на сумму 3 807 896 рублей от благотворительного фонда «Память Поколений». На эту сумму фонд предоставил оборудование для лечения, диагностики и реабилитации ветеранов Великой Отечественной войны, локальных войн, ликвидаторов радиационных катастроф, регулярно проходящих лечение в данном лечебном учреждении.
По результатам оценки работы Республиканского госпиталя для ветеранов войн, 12 июня 2019 года, в День России и День города, коллектив БУЗ УР «РГВВ МЗ УР» был удостоен высокой чести занесения на Доску почета города Ижевска.
При поддержке Главы и Правительства Удмуртской Республики в Госпитале проводятся организационно-правовые и технические мероприятия по развитию лечебно-диагностической и материально-технической базы Госпиталя, направленные на повышение эффективности и качества медицинской помощи ветеранам. Так, в преддверии празднования 75-й годовщины Победы в Великой Отечественной войне 1941-1945 годов, на выделенные средства бюджета Удмуртской Республики в Госпитале с 01.07.2019 года проводился капитальный ремонт. Выполненные работы позволили значительно улучшить условия оказания медицинской помощи и пребывания пациентов, в том числе лиц с ограниченными возможностями.
В 2019 году на базе БУЗ УР «Республиканский госпиталь для ветеранов войн МЗ УР» организован и функционирует Республиканский гериатрический центр (распоряжение Министерства здравоохранения Удмуртской Республики от 31.10.2019 №1244 «Об организации Республиканского гериатрического центра»). В связи с этим постоянно ведется методическая работа с медицинским организациями Удмуртской Республики, разрабатываются и направляются тематические методические рекомендации и информационные материалы, производится сбор и анализ отчетной информации по работе с ветеранами Удмуртской Республики, осуществление мониторинга реализации мероприятий регионального проекта «Разработка и реализация программы системной поддержки и повышения качества жизни граждан старшего поколения «Старшее поколение» национального проекта «Демография» в УР.
На территории БУЗ УР «РГВВ МЗ УР», переданной в безвозмездное пользование Ижевской епархии, с июня 2017 года идет строительство двух храмов – святой великомученицы Марины Антиохийской и Святителя Луки Крымского. Данный приход является первым в Удмуртской Республике «госпитальным храмом». С начала 2019 года госпитальный храм начал проводить богослужения. Посещение службы и общение со священником является важным психологическим аспектом для пациентов госпиталя.